Доктор Эггман (также известный как доктор Роботник) обнаруживает необычных птиц, известных как Flickies, которые могут перемещаться в любое место с помощью колец измерения. Успешно захватив Флики, Роботник превращает их всех в роботов, чтобы помочь ему найти Изумруды Хаоса.

Соник должен спасти Флики, освободив их из их роботизированной тюрьмы и помешать Роботнику найти Изумруды Хаоса.