Синоби: Повелитель войны установлен в конце бурной эры, известной как период Сэнгоку в феодальной Японии. История следует за взлетом и триумфом Токугавы Иэясу, человека, поглощенного его жаждой власти.

На фоне хаоса и конфликта разворачиваются последствия его стремления к доминированию.