Играйте за Рио Хазуки, 18-летнего японского мастера боевых искусств, стремящегося отомстить за смерть своего отца. В этой третьей части эпической серии Shenmue Рио пытается разгадать тайну Зеркала Феникса, артефакта, разыскиваемого убийцей его отца.

Его путешествие приводит его в захватывающее представление сельского Китая, наполненное активностью и окруженное красивыми пейзажами. Приключение Рио приводит его в города и горные деревни, где он может продолжить свое обучение, попробовать свои силы в азартных играх, играть в аркадные игры и работать неполный рабочий день, исследуя тех, кто знает правду за зеркалом Феникса.