Бог повелел Ною посадить двух животных на борт ковчега, чтобы спасти их от потопа. Однако несчастные люди со всего мира захватили различные виды животных, мешая Ною выполнять свою работу. Ной должен будет посетить эти места и освободить животных от людей, удерживающих их в плену. Noah's Ark - это игра в жанрах экшены.

Игрок, как и Ной, должен выбрать какой уровень из нескольких мировых локаций. Оказавшись на одном уровне, Ной может двигаться влево, утку, прыгать и стрелять гранулами прямо перед ним. Эти гранулы могут быть использованы для поражения вражеских существ и обнаружения скрытых предметов. В конце каждого уровня Ной сталкивается с более сильным врагом, который должен быть побежден.

Конечной целью Ноя является спасение животных, перечисленных для каждого уровня.