Исаак Кларк — инженер-любитель, выполняющий миссию по ремонту огромного горнодобывающего корабля USG Ishimura, только чтобы обнаружить, что что-то пошло не так. Экипаж корабля был убит, а его любимый партнер Николь потерялся где-то на борту.

Теперь, одинокий и вооруженный только своими инженерными инструментами и навыками, Исаак мчится, чтобы найти Николь, поскольку кошмарная тайна того, что произошло на борту Ишимуры, разгадывается вокруг него. Исаак, пойманный в ловушку враждебными существами под названием Некроморфы, сталкивается с битвой за выживание не только против нарастающих ужасов корабля, но и против собственного разрушающегося здравомыслия.